（1）项目招商部：招商引资，项目洽谈，企业进驻审批，收集各类科技、经济信息和市场情报，推荐投资合作项目，文件翻译，三资企业工商注册服务等。
（2）产业服务部：企业生产、科研、市场营销、财务管理、知识产权、标准化等全过程服务，内资企业工商注册、税务登记"一条龙"服务，进驻企业毕业认定，协助高新技术企业、产品和各类项目的申报，研究企业发展模式，指导和培训进驻企业进行现代化管理，做好企业数据统计和科技中介机构的管理等。
（3）综合服务部：对外宣传、接待、文秘、档案、内部财务管理、信息调研、内部管理等。
（4）物业管理部：孵化基地的水、电、设备、环境卫生、保安。企业策划等一系列物业后勤配套服务。
（5）信息部：孵化基地计算机网络管理及相关专业技术信息服务等。
一个成功的孵化器离不开五大要素：共享空间、共享服务、租用企业、孵化器管理人员、扶植企业的优惠政策。帮助新兴的小企业迅速壮大形成规模，为社会培养成功的企业和企业家。
主要作用
中国第一个孵化器专业博士颜振军认为企业孵化器在企业家创业过程中节省时间、少走弯路、营造创业者聚集效应，提高创业成功率；厦门大学的孙大海博士认为孵化器“通过为初创企业提供生产研发空间以及基础设施服务来降低创业成本并提高效率；连接风险投资机构和初创企业，降低双方存在的信息不对称；提供一种合理分摊创业者创业成本和创业风险的工具”。
