# 一、Linux是什么？
Linux是一种操作系统，在服务器端是绝对的主流。不同的用户可以通过网络连接服务器，独立操作，但权限隔离。不同于Windows的图形界面，Linux通过命令行操作，前者类似于word文档，有图有文字，后者类似于txt文档，只有文字。类似于Windows系统有文件夹，Linux系统有目录。最高级别的目录普通用户无法访问，只有管理员才能访问。
#二、为什么要学Linux？
组数据的上游分析因为计算量大，消耗资源多，所以基本只能在服务器上进行，而下游分析也可以在服务器上进行，因此学会使用Linux以及R语言，对于组学数据的处理是十分必要的。
# 三、Windows电脑上如何召唤Linux？
（1）安装xshell软件（除此之外，还有Finalshell等软件，不唯一）；
（2）登录服务器：打开xshell，点击左上角新建，修改名称，在主机处输入IP地址，点击确定之后弹出输入账号和密码的界面（还可以通过命令行登录）。
#四、Linux的基础命令
（1）pwd 显示当前路径
（2）mkdir 创建空目录（注意后面要接你想创建的空目录的名字）
（3）ls 显示当前目录下的子集，包括当前目录中的子目录和文件
（4）cd project 进入刚建好的project子目录
（5）cd - 返回上一层目录（还可以用cd ..）
（6）vi New_data.txt 新建脚本或文本文档（vi是Linux中的文本编辑器），输入回车之后进入了文本编辑界面，电脑切换到英文输入法，点击i键，就可以开始编辑文本，编辑好了之后按Esc键退出编辑模式，在左下角输入“:x”（有的电脑可能要按住shift键才能输入），这样就保存文档并退出了。
（7）cat New_data.txt 查看并直接将文档内容输出到屏幕
head New_data.txt 默认输出前10行，tail New_data.txt 默认输出后10行。
head -n 1 New_data.txt 自定义输出第1行
（8）cp New_data.txt Old_data.txt 意思是复制New_data.txt命名为Old_data.txt
（9）mv 将文件移入文件夹，或者重命名
mv Old_data.txt ../raw_data 将Old_data.txt移动到raw_data目录中
mv Old_data.txt Older_data.txt 将Old_data.txt重命名为Older_data.txt
（10）rm
rm Older_data.txt 删除文件
rm -r Dream_data 删除目录
